Фильм рассказывает историю жизни величайшего русского учёного, исследователя, путешественника и первопроходца Николая Николаевича Миклухо-Маклая. В фильме показаны самые интересные моменты из жизни учёного и его путешествий.

Один из последних детских фильмов, сделанных в лучших традициях советского кино, которое, как известно, к этому жанру относилось по-взрослому всерьез. В фильме есть хорошие красноармейцы, плохие белые и богатые, но, несмотря на это, смотреть «Макара-следопыта» интересно. Потому что сделано качественно и захватывающе. Плюс ко всему еще и великолепная игра актеров – почти все лица узнаваемы и обожаемы зрителями, хотя фильму уже несколько десятков лет: непревзойденный Олег Борисов в роли умного и коварного штабс-капитана; Владимир Этуш – хозяин грузинского ресторана и подпольщик; Игорь Дмитриев, сыгравший крайне уморительного англичанина; Александр Леньков и другие любимые артисты. Главные герои фильма – дети революционных лет, что слегка делает похожим этот фильм на знаменитых «Неуловимых мстителей». Они отчаянны, смелы и умны. И им все удается, в конце концов, после множества смешных и рискованных приключений. А зрителям удастся получить удовольствие от хорошего и доброго фильма, где все играют «на отлично».