Бушевала Гражданская война. На запад шел эшелон с боеприпасами, карательными отрядами и добром из сожженных деревень, наворованным для адмирала Колчака и его команды. Из теплушек доносились пьяные голоса солдат. Обходчик посигналил зеленым флажком: всё в порядке, путь безопасен и вдруг, раздался взрыв, состав громыхнул буферами, накренился и вагоны вместе с паровозом полетели под откос.
На месте аварии был обнаружен белый флажок, на котором корявым детским почерком были выведены два слова: "Армия Трясогузки"... "

Среди широкий полей и густых садов затерялась деревушка, где жил мальчик Мальчиш со своим отцом и старшим братом. Не визжат пули, не грохочут снаряды, не горят леса, только бы жить да радоваться, но беда всегда приходит нежданно - постучалась в дверь Война. Ушел на фронт отец Мальчиша, а за ним брат..., опустела деревня, но военные грозы продолжают греметь и не спится ночами Мальчишу Кибальчишу, больно ему за родную деревню, где остались лишь старики, да женщины и дети.
А однажды ночью, слышит Мальчиш шаги и шорох за окном...